PHP确实十分容易编写。但是PHP也有一些十分严重的缺陷。下面我会给出我的理由，为什么PHP不适合于比小型业余网站更大的网站。
　　
　　1、对递归的不良支持
　　
　　递归是一种函数调用自身的机制。这是一种强大的特性可以把某些复杂的东西变得很简单。有一个使用递归的例子是快速排序(quicksort)。不幸的是，PHP并不擅长递归。Zeev，一个PHP开发人员，说道：“PHP4.0(Zend)对密集数据使用了栈方式，而不是使用堆方式。也就是说它能容忍的递归函数的数量限制和其他语言比起来明显少。”见bug1901。这是一个很不好的借口。每一个编程语言都应该提供良好的递归支持。
　　
　　2、许多PHP模块都不是线程安全的
　　
　　在几年前，Apache发布了Web服务器的2.0版。这个版本支持多线程模式，在这个模式下，软件一个一部分可以同时运行多个。PHP的发明者说PHP的核心是线程安全的，但是非核心模块不一定是。但是十次有九次，你想要在PHP脚本中使用这种模块，但这又使你的脚本不能合适Apache的多线程模式。这也是为什么PHP小组不推荐在Apache2的多线程模式下运行PHP。不良的多线程模式支持使PHP常被认为是Apache2依然不流行的原因之一。
　　
　　3、PHP由于商业原因而不健全
　　
　　通过使用缓存，PHP的性能可以陡增500%[见基准测试]。那么为什么缓存没有被构建在PHP中呢?因为Zend——PHP的制造者，它在销售自己的ZendAccelerator，所以当然，他们不想抛弃自己的商业产品这块肥肉。
　　
　　但是有另一个可选择的：APC.(Zend后来推出ZendOptimizer，免费的加速器——译者)
　　
　　4、没有命名空间
　　
　　设想某个人制作了一个PHP模块用来阅读文件。模块中一个函数叫做read。然后另一个人的模块可以读取网页的，同样包含一个函数read。然后我们就无法同时使用这两个模块了，因为PHP不知道你要用哪个函数。但是有一个很简单的解决方法，那就是命名空间。曾经有人建议PHP5加入这个特性，但不幸的是他没有这么做。现在，没有命名空间，每个函数都必须加上模块名作为前缀，来避免名称冲突。这导致了函数名恐怖得长，例如xsl_xsltprocessor_transform_to_XML让代码难于书写和理解。
　　
　　5、不标准的日期格式字符
　　
　　很多程序员对日期格式字符都很熟悉，它是从UNIX和C语言中来的。其他一些编程语言采用了这个标准，但是很奇怪的，PHP有它自己的一套完全不兼容的日期格式字符。在C中，“%j”表示一年中的当天，在PHP中他表示一个月中的当天。然而使事情更混乱的是：Smarty(一个很流行的PHP模版引擎)的strftime函数和date_format函数，却使用了C/UNIX的格式化字符。