点击Install（安装）按钮后，MySQL安装帮助开始安装过程，并对系统进行下面章节描述的更改。
更改注册表

在典型安装中，MySQL安装帮助在HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\MySQL AB创建Windows注册键值。

MySQL安装帮助根据正安装的服务器的主要版本创建一个键值，例如 MySQL服务器5.1。它包含两个字符串值，Location和Version。Location字符串包含安装目录。在默认安装中，它包含C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.1\。Version字符串包含发布号。例如，安装MySQL Server 5.1.2-alpha，键值包含一个5.1.2-alpha值。

这些注册键值用来帮助外部工具识别MySQL服务器的安装位置，不需要扫描整个硬盘来确定MySQL服务器的安装路径。运行服务器时不需要注册键值，使用noinstall Zip文件时不创建注册键值。

更改启动菜单

MySQL安装帮助在Windows 启动菜单中创建一条新的条目，使用MySQL菜单，根据安装的MySQL的主版本来命名。例如，如果安装了MySQL 5.1, MySQL安装帮助在启动菜单中创建MySQL Server 5.1部分。

将在新启动菜单部分创建下面的条目：

·         MySQL命令行客户端：这是mysql命令行客户端的快捷方式，对其进行配置以连接为root用户。当连接时快捷方式提示输入root用户密码。

·         MySQL服务器实例配置向导：这是MySQL Configuration Wizard（配置向导）的快捷方式。使用该快捷方式来配置新安装的服务器，或重新配置已有的服务器。

·         MySQL文档：可以连接到保存在MySQL服务器安装目录下的文档。采用基本安装方式安装MySQL服务器时，该选项不可用。

更改文件系统

默认情况下，MySQL安装帮助将MySQL 5.1服务器安装到C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.1，其中Program Files是系统应用程序的默认位置，5.1是MySQL服务器的主要版本。这是建议的MySQL服务器的新安装位置，替换了前面的默认位置c：\mysql。

默认情况下，所有MySQL应用程序保存到目录C:\Program Files\MySQL下，其中Program Files是应用程序在Windows中的默认安装位置。开发机器上的典型MySQL安装应为：

C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.1C:\Program Files\MySQL\MySQL Administrator 1.0C:\Program Files\MySQL\MySQL Query Browser 1.0该方法使管理和维护具体系统上安装的MySQL应用程序更加容易。